W okresie 6 stycznia – 6 marca 2009 r. został ogłoszony trzeci, ostatni już nabór wniosków do Komponentu II „Ochrona środowiska i zrównoważony rozwój”. W porównaniu z poprzednimi naborami cieszył się on najmniejszym zainteresowaniem ze strony Wnioskodawców. Jedną z możliwych przyczyn tego zjawiska może być fakt, iż część potencjalnych Wnioskodawców realizowała już w tym czasie projekty z Funduszu dla Organizacji Pozarządowych w ramach pierwszego i drugiego naboru. Ponadto w okresie, w którym był realizowany pierwszy nabór na rynku istniała mniejsza możliwość uzyskania dofinansowania z różnych programów pomocowych. Na podstawie własnych analiz oraz informacji uzyskanej od Beneficjentów można wysunąć hipotezę, iż na mniejsze zainteresowanie Wnioskodawców miał również wpływ fakt, że w roku 2007 w którym został zorganizowany I nabór wniosków, nastąpiła przerwa we wdrażaniu programów operacyjnych w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego.
W ramach III naboru do Operatora złożonych zostało łącznie 188 wniosków o dofinansowanie, natomiast w latach ubiegłych było to odpowiednio 370 wniosków dla naboru pierwszego oraz 237 wniosków dla naboru drugiego.
Zgodnie z decyzją Komisji Oceniającej Wnioski z dnia 22 czerwca 2009 r. dofinansowanie w ramach Funduszu dla Organizacji Pozarządowych otrzymało 31 Wnioskodawców. Jeden z Wnioskodawców zrezygnował z realizacji projektu i nie podpisano z nim umowy o dofinansowanie.
W związku z korzystnym kursem złotówki wobec euro na przełomie 2009 i 2010 roku pojawiły się dodatkowe środki do rozdysponowania w ramach trzeciego naboru wniosków do Komponentu II. Komisja Oceniająca Wnioski 3 grudnia 2009 podjęła decyzję o dofinansowaniu dodatkowych 2 projektów, a 26 lutego 2010 dofinansowanie otrzymało kolejnych 8 projektów. W sumie w ramach trzeciego naboru dofinansowano aż 40 projektów.
Złożone przez Beneficjentów wnioski były jakościowo lepsze w stosunku do poprzednich naborów, o czym świadczą między innymi opinie asesorów oceniających projekty oraz analiza wyników oceny merytorycznej. Tylko 7 wniosków (niecałe 4%) otrzymało w ramach oceny mniej niż 101 punktów, a tylko 4 projekty (2% wniosków) swoim zakresem tematycznym nie wpisały się w cele i obszary tematyczne Komponentu II i w ramach pierwszego kryterium nie uzyskały wymaganych 50% uprawniających do pełnej oceny merytorycznej.
Ponownie jak w poprzednich naborach znaczna ilość wniosków (30 projektów) odpadła na etapie oceny formalnej i tym samym nie wzięła udziału w dalszym procesie oceny.
Trzeci nabór odznaczał się ponadto stosunkowo wysoką proporcją przyznanego dofinansowania. Mimo prawie o połowę niższej dostępnej kwoty alokacji, do dofinansowania zakwalifikowało się pierwotnie prawie 20% wniosków.
Pomimo szerokiego wyboru obszarów tematycznych w obrębie komponentu środowiskowego, największym zainteresowaniem ponownie cieszyły się obszar „Działania na rzecz poprawy świadomości społecznej” (41% projektów) oraz „Działania edukacyjne i informacyjne na rzecz ochrony środowiska” (29%). Najmniejsze zainteresowanie wśród Wnioskodawców wzbudziły natomiast obszary tematyczne: „Wsparcie zrównoważonego rozwoju regionalnego i lokalnego” (4%), „Wdrażanie przepisów prawnych z zakresu ochrony środowiska (1%) oraz „Łączenie ochrony dziedzictwa kulturowego z rozwojem lokalnych społeczności” (1%).
Ponad połowa wniosków, które otrzymały dofinansowanie należała do obszaru tematycznego „Działania na rzecz poprawy świadomości społecznej”.
Wśród Wnioskodawców po raz kolejny najliczniej reprezentowanym województwem było województwo mazowieckie (17% wniosków) oraz województwo śląskie (11% wniosków) i łódzkie (10%).